Qn-Util

目次

  • チュートリアル
    • README0
    • RMC Topology / FNC Generator
      • 概要
    • 設計方針
    • クラス構成
      • VaspStructure
      • QnNetworkAnalysis
      • RmcConstraintWriter
      • QnNetworkBuilder
    • 本ライブラリの特徴
    • RMC_POT における FNC と Topology
    • Qn ネットワーク解析
      • 目的
    • ネットワークモデル
    • Qn の定義
    • 解析手順
    • 1. 原子種抽出
    • 2. Central–Bridge 探索
      • cutoff
      • nearest
    • 3. Bridge–Second 探索
      • second_use_first_network = false
      • second_use_first_network = true
    • 4. Bridge 判定
    • 5. Qn 判定
    • 解析結果
    • FNC (Fixed Neighbour Constraint)
      • FNC とは
    • RMC_POT における FNC の位置付け
    • FNC の考え方
    • 本ライブラリでの FNC 生成
    • FNC Type
    • FNC Pair
    • FNC ファイル構成
    • Pair の対称性
    • Type 管理
    • FNC の特徴
    • 本ライブラリでの位置付け
    • Topology (*.top)
      • Topology とは
    • FNC との違い
    • RMC_POT における Bonded Potential
    • Topology の構成
    • 本ライブラリでの考え方
    • Bond の生成
    • Angle の生成
    • Bond Parameter
    • Angle Parameter
    • Atom 情報
    • Unit Topology
    • Network Topology
    • Unit Topology と Network Topology の違い
    • SiO₂ 実装との関係
    • RmcConstraintWriter の役割
    • JSON 設定ファイル
      • 概要
    • 設定の流れ
    • network
    • Neighbor 探索
      • First
      • Second
    • second_use_first_network
    • Bond Parameter
    • Angle Parameter
    • Atom 情報
    • FNC Type
    • JSON の役割
    • SiO₂ に依存する設定
    • 他材料への適用
    • 適用が難しい材料
    • 設計思想
    • SiO₂ 実装と他材料への展開
      • 概要
    • SiO₂ 固有となる部分
    • 1. Qn の定義
    • 2. SiO4 四面体
    • 3. Bond Parameter
    • 4. Angle Parameter
    • 汎用化されている部分
      • Structure
      • Neighbor Search
      • Network Model
      • Writer
    • どの材料まで利用できるか
      • そのまま利用しやすい材料
      • 少し修正が必要な材料
      • アルゴリズム変更が必要な材料
      • 適用が困難な材料
  • qn_util
    • qn_util package
      • Submodules
      • qn_util.config_error module
      • qn_util.install module
      • qn_util.qn_network_analysis module
      • qn_util.qn_network_builder module
      • qn_util.rmc_constraint_writer module
      • qn_util.vasp_structure module
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